在思想理論戰(zhàn)線上撥亂反正的同時，任仲夷以極大精力抓緊平反“四人幫”及其死黨在遼寧省制造的大量冤假錯案，從組織上反對“兩個凡是”。 1978年 10月 14日，任仲夷在遼寧省委常委擴大會議上聲討林彪、“四人幫”及其親信死黨在遼寧的罪行：“砸爛了從東北局、省委到基層的各級黨組織和各級領(lǐng)導(dǎo)機關(guān)，把一大批革命老干部，特別是各級黨委的主要負(fù)責(zé)同志打成叛徒、特務(wù)、走資派，大搞劃線站隊，把一大批干部和群眾誣蔑為‘當(dāng)了國民黨兵’；在清隊中，大搞法西斯專政，制造了大量的冤案、假案、錯案，全省僅集團性的冤假錯案就有 1200多起，加上個人的冤假錯案，牽連到 10萬多人，死了 2萬多人,把全省 11萬多干部以及民主人士攆到農(nóng)村，連老弱病殘者也不例外,一切誣蔑不實之詞都要統(tǒng)統(tǒng)推倒，所有的冤假錯案都要徹底平反昭雪。 ” 由于任仲夷和遼寧省委多數(shù)領(lǐng)導(dǎo)人對平反冤假錯案的重視，遼寧省平反冤假錯案的工作進展相當(dāng)迅速。

1978年 5月到 8月，先后公開宣布徹底平反涉及原省委書記、副省長等 300多人的所謂“國民黨軍統(tǒng)沈陽情報聯(lián)絡(luò)站特務(wù)集團案”、所謂“中國國民黨中央統(tǒng)計局沈陽站特務(wù)集團案”和“沈陽電信局軍統(tǒng)情報組集團案”、所謂“‘東北幫’叛黨投敵反革命集團案”等重大冤案。 到 1978年 10月底，遼寧全省共清查出集團性的冤假錯案 1300多起，涉及 4.4萬多人，個人冤假錯案涉及 6.28萬多人。全省共計應(yīng)作平反糾正處理的達 10萬多人，已平反糾正了 8萬多人，占應(yīng)平反總?cè)藬?shù)的 80％以上。接著，省委又為遼陽市委“反革命集團”案 等重大冤案進行平反；為原東北局和省委、省人委在“文化大革命”中被誣陷和錯誤處理的領(lǐng)導(dǎo)干部先后平反，恢復(fù)名譽；為因此受迫害的人徹底平反；為全部右派分子摘掉了帽子，對錯劃的右派予以改正；為平反的干部群眾落實了政策。到 1978年底，全省所有較大的冤假錯案均得到了平反昭雪。 在任仲夷和遼寧省委平反的冤假錯案中，最值得一提的是為震驚全國、引起海內(nèi)外巨大反響 的張志新冤案平反昭雪。 張志新， 1930年出生于天津一個愛國知識分子的家庭，解放后參加革命，上了大學(xué)，參加過解放軍， 1955年加入中國共產(chǎn)黨，后來在中共遼寧省委宣傳部文藝處工作。她眉清目秀身材苗條，性格活潑，愛好文藝，自幼酷愛音樂，尤擅吉它和小提琴。她勤奮學(xué)習(xí)馬克思主義和毛澤東著作，并善于用腦思考，凡事要問一個“為什么”。 在“文革”中，張志新出于對黨和國家前途命運的關(guān)心，明確表示對林彪不信賴，對江青有懷疑，對打倒和陷害劉少奇、鄧小平、賀龍、習(xí)仲勛等一大批革命老干部不滿，也對“文革”和毛澤東晚年的錯誤提出直率批評。因此，她遭到林彪、“四人幫”及其死黨等人殘酷迫害，于 1969年 9月被捕，在牢獄中、法庭上、刑場上仍然堅持真理，堅貞不屈。 1970年 8月 24日被硬加上現(xiàn)行反革命的罪名，判處無期徒刑。在長期監(jiān)禁中，她的精神和肉體遭受巨大傷害，但仍堅持自己的思考和表達，被誣蔑是“裝瘋賣傻”“抗拒改造”“頑固堅持反動立場”。“四人幫”死黨指令殺害她， 1975年 4月 3日宣布對她加處死刑，次日 4月 4日即執(zhí)行槍決。臨刑前，行刑者害怕她發(fā)出真理的呼喊，竟然把她按倒在地，殘忍地割斷她的喉嚨，慘無人道地秘密處決。這成為當(dāng)代中國的一樁奇冤大案。 任仲夷調(diào)到遼寧時，張志新犧牲已近兩年。 1979年 1月，在遼寧省委擴大會議上被揭露出來，引起任仲夷的高度重視，他在會上強調(diào)“公安司法部門應(yīng)抓緊清查這一案件”。2月 11日，他在省革委會五屆三次全會上再次強調(diào)：“這個冤案，一定要迅速查清，給予平反。 ”3月 9日，遼寧省委召開常委會聽取對張志新案復(fù)審匯報時，任仲夷提出堅決為張志新昭雪。 他說： “張志新同志是一個很好的黨員，堅持真理，堅持黨性，堅持斗爭，寧死不屈。她最后死在林彪、‘四人幫’及其死黨的屠刀之下。我主張和贊成定為烈士，予以徹底平反昭雪，對她的家屬、子女要很好照顧，由此造成的影響要徹底肅清。要開追悼大會。要號召黨員、革命者向她學(xué)習(xí)。省委要搞出一個很好的文件，給張志新同志以表揚。 ”“張志新同志是難得的好典 型，是中華民族的優(yōu)秀兒女，真夠得上一個藝術(shù)典型。 ” 在他的高度重視和督促下，省委有關(guān)部門當(dāng)月就迅速寫出《關(guān)于張志新案件復(fù)查情況和平反意見的報告》。遼寧省委作出決定，號召全體黨員和干部向張志新烈士學(xué)習(xí)。 任仲夷堅決為張志新平反并在全省大張旗鼓地號召向她學(xué)習(xí)，是要冒著巨大政治風(fēng)險的。當(dāng)時正刮起一股極左思潮，企圖否定剛確定的十一屆三中全會路線。張志新不僅同林彪、“四人幫”作斗爭，而且對“文化大革命”、對毛澤東主席的錯誤包括廬山會議上對彭德懷 的錯誤批判也提出了批評。后兩個問題，當(dāng)時屬于絕對的“禁區(qū)”。任仲夷為張志新平反，確實需要有相當(dāng)高的馬克思主義理論水平和政策水平，還需要有純潔的黨性、過人的膽識、果斷的魄力。他不僅承受來自中央一些領(lǐng)導(dǎo)人的壓力，就連當(dāng)年判處張志新死刑的原審法官 也稱是“按照實事求是定罪的”，還對復(fù)審案件的法官說：“毛主席、毛主席著作，她（張志新）反了。你能翻案？”

任仲夷果敢地繞過“禁區(qū)”，為這一平反定調(diào)為“張志新是反對林彪、‘四人幫’ ”，將張志新批評毛主席的言論籠統(tǒng)地列入神志不清時所講，“把這些說成是她的，是不公平的”。 這時，中共中央主席華國鋒正在遼寧視察，為一些單位題詞時，任仲夷建議：“請華主席給張志新題個字。”

華國鋒掃了他一眼，未予理睬，意思明顯是不給題。在一旁的幾位干部見狀，擔(dān)心平反之事有“行不得”之疑，事后神經(jīng)緊繃地問他怎么辦？任仲夷沉著堅定地說：“他不題可能有別的考慮，這不要緊，我們還是按省委的決定干。”

這一句“按省委的決定干”擲地有聲，表明任仲夷堅守黨的原則，哪怕壓力來自最高領(lǐng)導(dǎo)人也初衷不改！ 后來有人問他，給張志新作出平反決定前，是否向中央打招呼？他回答：“沒有。有錯必糾嘛，這是共產(chǎn)黨人義不容辭的職責(zé)。冤案有很多，沒有必要就張志新一人的案子請示中央。”他心里清楚，如果張志新案子送請當(dāng)時的中央批示，這案要翻就很難了。 在任仲夷主持下， 1979年 3月 31日，中共遼寧省委為張志新召開了平反昭雪大會，宣讀了《關(guān)于為張志新同志徹底平反昭雪，追認(rèn)她為革命烈士的決定》，宣布為她恢復(fù)名譽，恢復(fù)黨籍，追認(rèn)為革命烈士。 1979年 4月 5日，《遼寧日報》刊登《為真理而獻身》的長篇通訊， 首次公布張志新同林彪、江青斗爭的壯烈事跡。在任仲夷的支持下，《遼寧日報》對張志新的宣傳持續(xù)了 5個月，編出了 20多個專版。任仲夷還提議遼寧的報紙在顯著位置，刊發(fā)放大的張志新的照片。遼寧登載后，全國許多報刊也都登了張志新的大相片，她生動柔美的外貌和堅毅的內(nèi)心打動了無數(shù)人。 《人民日報》編輯部看了這篇長篇通訊極為感動，決定轉(zhuǎn)載，并將有關(guān)情況報告給中央秘書長、中央宣傳部部長胡耀邦。胡耀邦說，張志新是劉胡蘭式的英雄人物，《人民日報》應(yīng)該刊登。于是， 1979年 5月 25日《人民日報》在一版加 “編者按 ”發(fā)表張志新英勇斗爭事跡張志新平反的長篇通訊《要為真理而斗爭》。6月 11日，《人民日報》又加“編者按”發(fā)表張志新在獄中的一次答辯（摘錄）《以黨和人民的利益為第一生命》。 新華社向全國播發(fā)《人民日報》 5月 25日的長篇通訊和編者按語，各地報紙紛紛轉(zhuǎn)載文章及張志新照片。《光明日報》從 6月 5日到 13日，用四個版面的篇幅刊登張志新的事跡，其中有記者寫的長篇通訊《一份血寫的報告》，有張志新的愛人和女兒的回憶文章。 6月 16 日，《中國青年報》在刊登張志新事跡時，發(fā)表《學(xué) 習(xí)共產(chǎn)黨人的浩然正氣》的社論，熱烈贊揚張志新的崇 高品質(zhì)。 張志新烈士撼人心魄的英勇事跡經(jīng)媒體的報道，令 中國沸騰起來了。各種情緒以累積了 10年的驚人能量 在文章、詩歌、連環(huán)畫中持續(xù)發(fā)酵，迅速在海內(nèi)外引起 強烈的反響，張志新的英雄形象深深銘刻在中國人民心 上，大大推動了全國揭批 “四人幫 ”的進程，為思想解 放加了一把大火。

當(dāng)時全國各大報紙介紹張志新的文章如潮似涌，任仲夷并沒有停留在為張志新平反昭雪和贊揚歌頌這一層次上，而是進行深層次的思索，總結(jié)出深刻的歷史教訓(xùn)。 1979年 8月，他在五屆全國人大二次會議上就張志新冤案作了系統(tǒng)的專題發(fā)言。這篇發(fā)言以《吸取歷史教訓(xùn)，健全社會主義法制——談張志新同志被害這種冤案產(chǎn)生的原因和有關(guān)問題》為標(biāo)題，刊登在《工人日報》上，《人民日報》于 1979年 8月 30日作了轉(zhuǎn)載。 任仲夷提出應(yīng)當(dāng)從張志新的冤案中總結(jié)吸取 4條非常重要的教訓(xùn)：一、我們的專政制度應(yīng)當(dāng)在法律上明確地分清罪與非罪的界限，并把政治思想反動與有行動的刑事犯罪區(qū)別開來。二、對敵專政也要嚴(yán)格按照法律程序辦事，也要采取合法的手段。對敵斗爭的擴大化，在審訊中搞逼供信甚至采取極不人道的法西斯手段，必然在革命隊伍內(nèi)部造成大批冤假錯案。三、要加強社會主義民主和社會主義法制，黨內(nèi)生活必須正常化。四、最根本的是必須防止林彪、“四人幫”一類陰謀家篡奪黨和國家的領(lǐng)導(dǎo)權(quán)。